喀什大学医学院于2015年11月获新疆维吾尔自治区党委机构编制委员会批复，2021年在自治区党委、人民政府正确领导下，在自治区教育工委、教育厅亲切关怀指导及援疆省市、喀什地委、行署的大力支持和帮助下，学校抽调专门力量成立医学院筹备建设办公室，在广泛开展社会调研论证的前提下，完成专业课程体系建设和人才培养方案论证工作，并于2021年8月按照教育部要求提交预防医学、护理学两个专业申报书，2022年2月22日，经教育部备案并审核通过。2022年9月，喀什大学迎来首批医学专业类本科生。

学院现有预防医学、护理学、卫生检验与检疫三个专业，现有在校生927人，教职工96人（含银龄教师2人，援疆支教教师6人，援疆干部2人，外聘兼职教师43人）。为满足医学生临床实践学习需求，不断促进医学院与地方医疗卫生机构“医、教、研”合作能力水平提升，学校先后与南疆三地州相关三级甲等医院、疾病预防控制中心、南疆国家区域医疗中心、喀什海关技术中心等签订临床教学医院9个，实践教学基地5个，挂牌喀什地区第二人民医院为喀什大学附属第一医院，挂牌喀什地区疾病预防控制中心（喀什地区卫生监督所）为喀什大学附属喀什地区疾病预防控制中心（喀什地区卫生监督所），能够有力地保证专业可持续发展。

学院设立在紧邻喀什地区第一人民医院的高台校区，拥有较为完善的教学、实验和文化、体育、卫生等公共设施。按照学校规划，已将高台校区1号综合楼中部1~3 楼设置为医学院行政办公及科研用楼，右侧为医学院临床教学实训中心，左侧为专业课教室；总面积为 10000余平方米实验楼为医学院实验教学用楼，目前学校已投资近8000万元，建成高标准、现代化的满足基础医学、预防医学、护理学、卫生检验与检疫实训教学需求的实验教学中心，南疆首个SPF级专业实验动物房，以及可全面覆盖基础医学研究相关关键领域科研需求的高标准科研平台，形成教研双轨同步发展的“四中心一平台”。

今后，学院将立足喀什，面向南疆，辐射中亚，紧紧围绕社会稳定和长治久安的新疆工作总目标，全面贯彻落实党中央确立的治疆方略，高起点、高水平开办护理学、预防医学、卫生检验检疫、临床医学、医学检验技术、药学、口腔医学、妇幼保健医学、眼视光医学及医学影像技术等医学类本科专业，适度发展医学类专业硕士研究生教育，培养大批“下得去、用得上”的医疗卫生专业技术和管理人才，满足服务区域经济社会发展和医疗卫生事业发展对人才需求，为丝绸之路经济带核心区“医疗服务中心”提供智力支撑和人才保障，为提升南疆医疗卫生事业发展水平、保障改善民生、巩固新疆社会稳定和长治久安做出新的贡献。