2021年9月喀什大学正式启动医学院建设筹备工作；2022年9月招收首届预防医学、护理学专业本科生；2023年9月招收首届卫生检验与检疫专业本科生；2025年7月喀什地区第二人民医院正式挂牌为喀什大学附属第一医院；2026年4月成功获批临床医学本科专业，拟于同年9月进行首届招生。学院现有在校生927人，教职工96人（含银龄教师、援疆干部、援疆支教教师、外聘兼职教师）；拥有附属医院、临床教学医院11家，其中综合三级甲医院5家，实践教学基地6个，为提升医学类专业人才培养质量、构建完善的医教研融合育人体系奠定了坚实基础。

学院坐落于与千年喀什古城交相辉映的高台校区，拥有较为完善的教学、实验、文化、体育等公共设施。建成了总面积超过10000平方米的高标准现代化教学科研支撑体系，涵盖基础医学实验教学中心、公共卫生实验教学中心、临床技能实训中心、实验动物中心以及医学科研平台，形成了教学与科研双轨同步发展的“四中心一平台”格局。其中，实验动物中心是南疆地区首个标准化SPF级实验动物中心；临床技能实训中心设备先进、功能完善，达到国家级实验教学示范中心建设标准。2024年以来，学院先后获批“自治区级实验教学中心项目—医学实验教学示范中心”“自治区级现代产业学院项目—喀什大学华大基因生命健康产业学院”“自治区级实践教学基地项目—喀什地区第二人民医院医学实践教育基地”。

今后，学院将立足南疆，面向全国，辐射中亚，紧紧围绕社会稳定和长治久安的新疆工作总目标，全面贯彻落实党中央确立的治疆方略，聚焦地方医疗卫生领域发展需求及经济社会建设刚需，积极推进医学类本科专业布局与建设工作，合理开设适配区域健康事业发展的医学类本科相关专业，积极发展专业学位研究生教育，培养大批“扎得深、立得稳、靠得住、顶得上”的医疗卫生专业技术和管理人才，满足区域经济社会发展和医疗卫生事业发展对人才的需求，为丝绸之路经济带核心区“医疗服务中心”提供智力支撑和人才保障，为提升南疆医疗卫生事业发展水平、保障和改善民生、巩固新疆社会稳定和长治久安做出新的贡献。